Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SLC2A3P4-201ENST00000521259 1471 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AMYH02020865.1-207ENST00000617096 458 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 OPCML-IT2-201ENST00000533260 398 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 SPP2-201ENST00000168148 1024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL596268.1-201ENST00000427910 1048 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
IFT88Q13099 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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