Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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TRAF1Q13077 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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TRAF1Q13077 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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