Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC091965.3-201ENST00000506236 208 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms