Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC005828.7-201ENST00000607331 556 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
RPS29P62273 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC145285.4-201ENST00000568183 540 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms