Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
TMPOP42166 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC022507.1-201ENST00000548349 1505 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 LINC01720-201ENST00000413356 2216 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
TMPOP42166 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
TMPOP42166 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TMPOP42166 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
TMPOP42166 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
TMPOP42166 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms