Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXD12P35452 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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HOXD12P35452 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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HOXD12P35452 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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HOXD12P35452 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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HOXD12P35452 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AF064860.2-201ENST00000457325 1542 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 CDH19-203ENST00000540086 1963 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
HOXD12P35452 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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