Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 GRM8-206ENST00000444921 1251 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC080129.1-201ENST00000457815 406 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RN7SL706P-201ENST00000460079 292 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RN7SL89P-201ENST00000480252 283 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC114300.1-201ENST00000502347 280 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC107385.1-201ENST00000507985 778 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL591848.3-201ENST00000570141 2968 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AP005131.5-201ENST00000585817 498 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC005537.1-202ENST00000585996 666 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC005262.1-201ENST00000588562 362 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 LINC01778-208ENST00000635288 1095 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 ZMAT4-201ENST00000297737 2466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 TTC39B-206ENST00000507285 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 GTF2IP12-202ENST00000634317 5052 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 XIRP2-202ENST00000409043 3292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 ZNF430-203ENST00000595401 3021 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CSF2RA-206ENST00000381529 1816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 PTPRR-203ENST00000378778 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PTPREP23469 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 SLC5A1-201ENST00000266088 5061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 SHC4-203ENST00000537958 1447 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 ENOX1-AS1-201ENST00000444442 3907 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 SPRY1-202ENST00000394339 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 LINC01234-202ENST00000547963 2088 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 ZNF502-204ENST00000449836 3173 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CRIP1P3-201ENST00000416794 220 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC005840.2-201ENST00000447193 355 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 TPT1-AS1-213ENST00000521336 759 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC091096.1-201ENST00000521955 614 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC104031.1-201ENST00000527726 372 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC133565.1-201ENST00000569218 488 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AC006967.3-201ENST00000594086 1093 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 RN7SL82P-201ENST00000611435 237 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
PTPREP23469 AL354733.2-202ENST00000615485 742 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms