Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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PTPRCP08575 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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PTPRCP08575 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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PTPRCP08575 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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PTPRCP08575 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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PTPRCP08575 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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PTPRCP08575 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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PTPRCP08575 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRCP08575 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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