Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MALAT1-203ENST00000544868 480 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
TM6SF1Q9BZW5 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
TM6SF1Q9BZW5 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms