Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
COG3Q96JB2 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms