Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AL158212.1-201ENST00000428766 315 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AL138733.2-201ENST00000431947 804 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC005699.1-204ENST00000509244 747 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC013549.3-201ENST00000528792 419 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC117373.1-201ENST00000544036 392 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 LINC01028-201ENST00000586373 1045 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AL589182.1-201ENST00000611785 320 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
CBFBQ13951 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ATP5EP2-201ENST00000381026 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CBFBQ13951 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms