Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
CUL4BQ13620 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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