Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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TRAF1Q13077 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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TRAF1Q13077 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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TRAF1Q13077 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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TRAF1Q13077 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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TRAF1Q13077 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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TRAF1Q13077 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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TRAF1Q13077 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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TRAF1Q13077 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TRAF1Q13077 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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