Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AL513303.1-201ENST00000432452 591 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC004943.1-203ENST00000624370 1074 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 AL591178.2-201ENST00000429191 461 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 AP001257.1-201ENST00000533106 385 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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FOXD4Q12950 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXD4Q12950 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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