Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 C11orf1-203ENST00000529270 1437 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.36
ACADSBP45954 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SMARCE1P6-201ENST00000398372 1216 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
ACADSBP45954 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms