Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 MS4A12-201ENST00000016913 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 RNA5SP260-201ENST00000363849 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 RPL7AP72-201ENST00000417266 768 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 RPL19P21-201ENST00000424919 591 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 DPP10-AS1-202ENST00000448663 644 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AL590004.3-201ENST00000450255 443 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AL353615.1-201ENST00000450850 390 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 RN7SL549P-201ENST00000478997 282 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 SEC62-AS1-201ENST00000479626 346 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 IGHVII-22-1-201ENST00000517888 265 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AL133304.3-201ENST00000550089 477 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC034102.7-201ENST00000550840 470 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AL358334.1-201ENST00000557152 174 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC034105.2-201ENST00000561866 238 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 LINC02178-201ENST00000566876 425 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 SUPT4H1-207ENST00000581540 668 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC211469.1-201ENST00000604263 394 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 EIF5P2-201ENST00000618904 1035 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 MFSD8-234ENST00000641503 1082 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
LINC00587B1AMM8 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms