Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL354953.1-201ENST00000457852 479 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL5P3-201ENST00000493817 889 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093878.1-201ENST00000515630 432 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105202.1-203ENST00000518024 875 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 IGHVII-51-2-201ENST00000519778 259 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RRM1-AS1-201ENST00000529323 346 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 OR5G5P-204ENST00000627642 621 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K19-206ENST00000392918 1460 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ARL2-SNX15V9GYD0 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms