Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL353593.3-201ENST00000602778 764 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC012668.3-202ENST00000417485 1642 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ELK3-206ENST00000552142 1242 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RPS27L-208ENST00000635699 693 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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