Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 DOCK11P1-201ENST00000553480 5932 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 ZNF192P1-201ENST00000440790 1628 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 RERGL-201ENST00000229002 1147 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 PSMD10P2-203ENST00000627340 914 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CDKN3Q16667 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms