Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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CHD4Q14839 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
CHD4Q14839 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
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