Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC8.16□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 TRIM2-201ENST00000338700 6735 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 AC110769.3-201ENST00000624567 1173 ntBASIC8.15□□□□□ -1.1
NCOA4Q13772 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.1
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NCOA4Q13772 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
NCOA4Q13772 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
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