Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ZCCHC11-201ENST00000257177 5743 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 OR1A1-201ENST00000304094 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC01013-203ENST00000443303 569 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC099511.1-201ENST00000564561 590 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MAPK10-371ENST00000641952 5209 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CTNNA2-218ENST00000541047 2870 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AL356019.2-201ENST00000556738 3829 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 XRCC6P4-201ENST00000518193 2067 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 ADGRE3-201ENST00000253673 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 LINC01687-201ENST00000416327 795 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
PTPN13Q12923 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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