Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 LINC01093-201ENST00000506479 634 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL157871.6-201ENST00000553954 206 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AP000662.1-201ENST00000530952 487 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
LMAN2Q12907 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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