Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC024589.2-201ENST00000605642 1294 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL445649.1-201ENST00000615941 691 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC007744.1-201ENST00000607540 2289 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 SPANXB1-201ENST00000449283 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PRKCHP24723 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms