Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC016822.1-201ENST00000457975 439 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC097451.1-201ENST00000507388 653 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC011603.2-202ENST00000552893 504 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL445383.1-201ENST00000554689 874 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC013652.1-204ENST00000558209 489 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC097467.3-210ENST00000597939 705 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC025171.4-201ENST00000607250 1047 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 EXD1-202ENST00000458580 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC083855.1-201ENST00000440041 258 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 RN7SL104P-201ENST00000498686 293 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC104825.1-201ENST00000503186 685 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC139491.5-201ENST00000510029 920 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
EHD3Q9NZN3 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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