Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 PSMC1P2-201ENST00000423961 1204 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 OR9L1P-201ENST00000529493 933 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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CCDC93Q567U6 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
CCDC93Q567U6 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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