Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC005736.2-201ENST00000571302 774 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TRAPPC3L-201ENST00000356128 2421 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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RTL8BQ17RB0 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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RTL8BQ17RB0 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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RTL8BQ17RB0 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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RTL8BQ17RB0 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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RTL8BQ17RB0 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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RTL8BQ17RB0 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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RTL8BQ17RB0 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL034397.2-201ENST00000424241 857 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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