Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 RGS8-203ENST00000367557 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL109918.1-202ENST00000406724 436 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 LINC01392-201ENST00000419883 565 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL365295.1-204ENST00000425648 553 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 SLC25A24P1-202ENST00000434803 1220 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC244505.2-201ENST00000435089 759 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 OR3B1P-201ENST00000437536 893 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC231532.1-201ENST00000438584 312 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 RN7SL508P-201ENST00000464472 303 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 RN7SL12P-201ENST00000473849 290 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC084878.1-201ENST00000480555 648 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 TMEM196-205ENST00000493519 687 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC023794.3-204ENST00000510754 236 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC090568.2-203ENST00000521433 579 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 TUBAP4-201ENST00000569261 416 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC087499.3-201ENST00000578210 717 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC091132.5-205ENST00000585761 560 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CSTL1-205ENST00000619238 477 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CCL4L2-216ENST00000620098 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 KIF27-201ENST00000297814 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
FXNQ16595 PIGN-225ENST00000638435 4382 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ASB4-202ENST00000325885 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 POC1B-AS1-201ENST00000605233 8041 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 TMEM246-203ENST00000374851 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
FXNQ16595 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms