Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PTPRM-203ENST00000400060 5030 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC02334-201ENST00000617568 4959 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01694-202ENST00000441095 6721 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GARNL3-202ENST00000373387 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 5570 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC245047.5-201ENST00000437312 556 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OFCC1-218ENST00000622909 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DMC1-203ENST00000428462 2082 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 HIP1-204ENST00000434438 7066 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 C1QTNF7-201ENST00000295297 4516 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ARID1A-202ENST00000374152 6460 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL035422.2-201ENST00000603059 565 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SLFN13-211ENST00000542635 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ORAI2-210ENST00000611770 10679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF610-207ENST00000601151 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SCN5A-206ENST00000425664 8450 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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