Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 CFI-204ENST00000510800 667 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC090241.1-201ENST00000587732 621 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 ZNF431-203ENST00000594425 610 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL121830.1-206ENST00000608476 1254 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SS18Q15532 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC007255.1-201ENST00000450540 1376 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SS18Q15532 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC004023.1-201ENST00000561473 1744 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SS18Q15532 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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