Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC104126.1-201ENST00000504004 711 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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RFTN1Q14699 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RFTN1Q14699 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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