Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 BMP6P1-201ENST00000431230 679 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC100768.2-201ENST00000534068 683 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 HPS5-207ENST00000537258 1275 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 ELMO1-AS1-201ENST00000419535 528 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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ATP1A4Q13733 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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ATP1A4Q13733 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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ATP1A4Q13733 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC073539.3-201ENST00000601905 386 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 AC022613.3-201ENST00000560740 1346 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ATP1A4Q13733 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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