Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RDH11-203ENST00000553384 1926 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 ATM-215ENST00000530958 5718 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 NT5C2-203ENST00000404739 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 TAS2R7-201ENST00000240687 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 LL22NC01-81G9.3-201ENST00000400221 992 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 EIF4A1P2-201ENST00000422633 1220 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC010761.3-201ENST00000578819 499 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC007671.1-201ENST00000616957 830 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 PMFBP1-201ENST00000237353 3527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RNGTT-203ENST00000538899 1374 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FHL3Q13643 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms