Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CDH18Q13634 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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CDH18Q13634 OR4K5-201ENST00000315915 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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CDH18Q13634 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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CDH18Q13634 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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CDH18Q13634 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
CDH18Q13634 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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