Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC068759.1-201ENST00000447709 470 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 CRYZ-201ENST00000340866 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 INTS9-AS1-201ENST00000520055 548 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NEUROD1Q13562 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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