Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RPS7P12-201ENST00000422385 582 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 RNA5SP152-201ENST00000365184 110 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 AC005833.3-202ENST00000544741 770 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC011921.2-201ENST00000589465 152 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC139792.1-201ENST00000607051 647 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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