Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RPS14P8-201ENST00000478778 369 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
E2F1Q01094 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
E2F1Q01094 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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