Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 TMC5-205ENST00000542583 4872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 NCR2-201ENST00000373083 1154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 WBP1LP1-201ENST00000460451 896 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 RN7SL145P-201ENST00000469955 296 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC091982.1-202ENST00000473923 343 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 OXR1-212ENST00000521592 993 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AP003084.1-201ENST00000524828 742 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 LINC01497-201ENST00000420427 665 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
SRRTQ9BXP5 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
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