Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC079248.1-201ENST00000427568 1546 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AP003385.3-201ENST00000472498 287 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AF117829.1-205ENST00000524190 383 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL049541.1-201ENST00000630976 642 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PLEKHA5-216ENST00000540972 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC139713.1-202ENST00000512366 460 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RTL8BQ17RB0 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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