Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 TAF12-202ENST00000373824 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDK4Q16654 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDK4Q16654 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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