Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC079362.1-202ENST00000547089 278 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC069240.2-201ENST00000550242 609 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC00663-206ENST00000589910 732 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL121583.1-201ENST00000612444 682 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 WDR64-204ENST00000437684 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 GOSR2-238ENST00000640495 3395 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 POGZ-218ENST00000531094 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 UTY-213ENST00000612274 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC025040.2-201ENST00000558657 1852 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC02535-201ENST00000455071 2513 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 DYNC2LI1-203ENST00000398823 2903 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ZFP42-203ENST00000618147 2338 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 DHX32-202ENST00000368721 2389 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
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GRIK4Q16099 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
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GRIK4Q16099 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC026336.1-201ENST00000466577 351 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
GRIK4Q16099 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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