Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ENTPD1-201ENST00000371205 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SIX1Q15475 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 CCL15-204ENST00000617897 1073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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SIX1Q15475 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SIX1Q15475 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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SIX1Q15475 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SIX1Q15475 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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