Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL157831.2-201ENST00000564681 3095 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 CPS1-212ENST00000619804 1542 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC009237.1-201ENST00000442127 744 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC078789.1-201ENST00000547084 477 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AL162377.2-201ENST00000624532 337 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
RFTN1Q14699 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms