Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 PBLD-203ENST00000336578 2449 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
SP140Q13342 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 PPP2R3A-202ENST00000334546 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 HSPD1P1-201ENST00000503199 1726 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
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SP140Q13342 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
SP140Q13342 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
SP140Q13342 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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