Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SUMO2P7-201ENST00000511179 285 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 LECT2-203ENST00000512872 762 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
SRSF5Q13243 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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