Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01476-202ENST00000584262 635 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 LINC01386-201ENST00000506196 440 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PTP4A2Q12974 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms