Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 MS4A6A-213ENST00000530839 1383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 MEPE-203ENST00000424957 2022 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 NOX1-203ENST00000372964 661 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 FAM155A-IT1-201ENST00000449551 819 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 LIPF-201ENST00000238983 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
APOBRQ0VD83 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms