Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 Y_RNA.710-201ENST00000516975 110 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZNF426-202ENST00000535489 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RPS29P62273 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPS29P62273 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPS29P62273 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPS29P62273 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPS29P62273 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPS29P62273 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RPS29P62273 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPS29P62273 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPS29P62273 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPS29P62273 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RPS29P62273 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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