Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 RANP2-201ENST00000456833 229 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AC105389.1-201ENST00000510602 561 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCN2BO60939 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SCN2BO60939 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SCN2BO60939 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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SCN2BO60939 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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SCN2BO60939 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 AC104248.1-201ENST00000522244 481 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 AP000755.1-201ENST00000527100 507 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 OR7A1P-202ENST00000641542 1158 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCN2BO60939 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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