Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 DTNA-228ENST00000597674 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AP000812.1-201ENST00000378140 477 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL079341.1-201ENST00000404701 1207 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 VAMP3-202ENST00000470357 954 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC068647.2-202ENST00000485020 390 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR11H12-201ENST00000550708 1085 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TRIM75P-201ENST00000503032 1407 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP442-201ENST00000365050 107 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 YWHAZP5-201ENST00000419975 730 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC009303.1-201ENST00000426307 352 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC105391.1-201ENST00000503155 1045 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC105150.1-201ENST00000518011 551 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC022973.4-201ENST00000524100 917 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 PTER-205ENST00000535784 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SH3BP4Q9P0V3 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms